Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GDAP2Q9NXN4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GDAP2Q9NXN4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GDAP2Q9NXN4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms