Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM8AQ9HCN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM8AQ9HCN3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms