Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NOD2Q9HC29 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NOD2Q9HC29 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NOD2Q9HC29 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms