Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM39BQ9GZU3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM39BQ9GZU3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms