Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CARD11Q9BXL7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARD11Q9BXL7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARD11Q9BXL7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms