Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC106Q9BWC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC106Q9BWC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms