Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMED9Q9BVK6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms