Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSEN34Q9BSV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TSEN34Q9BSV6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSEN34Q9BSV6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms