Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GABRG3Q99928 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRG3Q99928 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms