Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C2CD4AQ8NCU7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C2CD4AQ8NCU7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms