Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00301Q8NCQ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00301Q8NCQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms