Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC82Q8N4S0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC82Q8N4S0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC82Q8N4S0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms