Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC11Q7Z392 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC11Q7Z392 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC11Q7Z392 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms