Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHST9Q7L1S5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST9Q7L1S5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms