Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC25A48Q6ZT89 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC25A48Q6ZT89 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms