Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CASC2Q6XLA1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CASC2Q6XLA1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms