Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRSAM1Q6UWE0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRSAM1Q6UWE0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRSAM1Q6UWE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms