Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LETMD1Q6P1Q0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETMD1Q6P1Q0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETMD1Q6P1Q0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms