Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LCN8Q6JVE9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LCN8Q6JVE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LCN8Q6JVE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.4 ms