Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD3Q5T2D3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OTUD3Q5T2D3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms