Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C4orf17Q53FE4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C4orf17Q53FE4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C4orf17Q53FE4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms