Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TAF1CQ15572 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TAF1CQ15572 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TAF1CQ15572 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms