Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLF9Q13886 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLF9Q13886 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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