Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CUL4AQ13619 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CUL4AQ13619 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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