Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGCGQ13326 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SGCGQ13326 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
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