Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE3AQ05086 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE3AQ05086 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE3AQ05086 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms