Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPTBN1Q01082 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms