Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPP2R2BQ00005 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PPP2R2BQ00005 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms