Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB15P59190 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB15P59190 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB15P59190 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB15P59190 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB15P59190 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB15P59190 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB15P59190 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB15P59190 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB15P59190 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB15P59190 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB15P59190 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB15P59190 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB15P59190 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB15P59190 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB15P59190 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB15P59190 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB15P59190 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB15P59190 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB15P59190 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB15P59190 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB15P59190 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB15P59190 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB15P59190 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB15P59190 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms