Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRKAA2P54646 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAA2P54646 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAA2P54646 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms