Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RANGAP1P46060 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
RANGAP1P46060 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RANGAP1P46060 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms