Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VHLP40337 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VHLP40337 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VHLP40337 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VHLP40337 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VHLP40337 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VHLP40337 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VHLP40337 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VHLP40337 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VHLP40337 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VHLP40337 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VHLP40337 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VHLP40337 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms