Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
ITGAEP38570 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ITGAEP38570 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ITGAEP38570 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms