Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPA3P35244 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPA3P35244 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPA3P35244 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPA3P35244 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPA3P35244 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPA3P35244 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPA3P35244 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms