Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN4P29074 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN4P29074 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms