Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SCG2P13521 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SCG2P13521 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SCG2P13521 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SCG2P13521 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCG2P13521 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCG2P13521 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SCG2P13521 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SCG2P13521 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCG2P13521 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCG2P13521 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SCG2P13521 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SCG2P13521 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SCG2P13521 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SCG2P13521 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SCG2P13521 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms