Protein–RNA interactions for Protein: P05771

PRKCB, Protein kinase C beta type, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCBP05771 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKCBP05771 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKCBP05771 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKCBP05771 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms