Protein–RNA interactions for Protein: P05023

ATP1A1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1P05023 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP1A1P05023 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP1A1P05023 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP1A1P05023 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms