Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBB4AP04350 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBB4AP04350 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBB4AP04350 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms