Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNAP02545 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNAP02545 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNAP02545 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNAP02545 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNAP02545 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNAP02545 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNAP02545 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNAP02545 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNAP02545 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNAP02545 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMNAP02545 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMNAP02545 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMNAP02545 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMNAP02545 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LMNAP02545 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LMNAP02545 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNAP02545 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNAP02545 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LMNAP02545 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LMNAP02545 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNAP02545 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNAP02545 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNAP02545 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LMNAP02545 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LMNAP02545 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms