Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRPF40AO75400 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRPF40AO75400 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRPF40AO75400 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms