Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMAD6O43541 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMAD6O43541 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMAD6O43541 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms