Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC3O15379 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDAC3O15379 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms