Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC27A2O14975 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC27A2O14975 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A2O14975 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms