Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF12Q9Y4X4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLF12Q9Y4X4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms