Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PLXND1Q9Y4D7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PLXND1Q9Y4D7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXND1Q9Y4D7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms