Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms