Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC54.24■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC54.24■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC54.23■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC54.22■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.22■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.22■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC54.21■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC54.21■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC54.21■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.21■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC54.2■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC54.2■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.2■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC54.19■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC54.19■■■■■ 6.27
NISCHQ9Y2I1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.19■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC54.19■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC54.18■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.18■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.17■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC54.17■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC54.17■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC54.16■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC54.16■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC54.16■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.15■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC54.15■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.15■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC54.15■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC54.14■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC54.14■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC54.14■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC54.14■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC54.14■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.13■■■■■ 6.26
NISCHQ9Y2I1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.12■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC54.11■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC54.11■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC54.11■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC54.11■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC54.1■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC54.1■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC54.09■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC54.09■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC54.09■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC54.09■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC54.08■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC54.07■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC54.07■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
NISCHQ9Y2I1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC54.06■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC54.06■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.05■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC54.05■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC54.05■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.04■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC54.04■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC54.04■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.04■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC54.04■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.03■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.02■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC54.02■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC54.02■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.02■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC54.01■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC54.01■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC54■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54■■■■■ 6.24
NISCHQ9Y2I1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC53.99■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC53.99■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.99■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.99■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC53.98■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.98■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC53.98■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC53.98■■■■■ 6.23
NISCHQ9Y2I1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC53.97■■■■■ 6.23
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