Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACSL6Q9UKU0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACSL6Q9UKU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms