Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPG2Q9UBF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPG2Q9UBF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms